Когда-то на форуме был моряк, снимающий судна прекрасные видео. Ваш вопрос поднимался. Он ответил, что после взлёта компас быстро приходил в себя сам.
Я бы ещё при включённом дроне и открытой вкладке с компасом прошёлся бы по судну и выбрал бы место, где исчезла красная шкала. Оттуда бы и взлетал.
+ обязательно сменил бы настройку, чтобы при глюкнувшем компасе GPS не отключался - g_config_fdi_switch_gps_with_fdi на 0
